在嵌入式总线通讯协议中，PCI、PMC、CPCI（CompactPCI）和VME协议各有其特点和适用场景，因此无法简单地判断哪个更好。选择哪种协议取决于具体的应用需求、系统架构、性能要求以及成本考虑。

PCI总线定义了32位数据总线，可扩展为64位，支持突发读写操作，最大传输速率可达132MB/s，可同时支持多组外围设备。它具有较高的数据传输速率和灵活的扩展性，适用于需要高速数据传输和多个设备连接的嵌入式系统。

PMC（Peripheral Module Connect）是一种用于连接高速外设模块的总线标准，具有高速、低延迟的特点。它适用于需要高性能外设连接的嵌入式系统，如信号处理、图像处理等领域。

CPCI（CompactPCI）是在PCI总线基础上改造而来，采用了无源总线底板结构，适用于工业环境应用。它提供了高性能的核心系统，并考虑了传统总线产品的兼容性，为工业计算机提供了一种可靠、高效的解决方案。

VME总线协议则结合了电气标准和机械形状因子，适用于紧密耦合的硬件构架。它在航空、军事、工业等领域有广泛的应用，以其高可靠性和稳定性著称。

因此，在选择嵌入式总线通讯协议时，需要根据实际应用需求进行综合评估。考虑系统的性能要求、设备连接需求、成本预算以及可维护性等因素，选择最适合的协议。同时，还需要考虑协议的兼容性、标准化程度以及供应商的支持情况，以确保系统的稳定运行和后续维护的便利性。